ผู้ป่วย (นับถือศาสนาพุทธ) ต้องยกขันไหว้ครู ส่วนผู้ป่วยที่นับถือศาสนาอื่นไม่จำเป็นต้องทำพิธีไหว้ครู
หมอจะยกขันไหว้ครู บอกเล่าบรมครู ปู่ชีวกโกมารภัจจ์ ปู่ไกร และครูผู้ถ่ายทอด โดยมีผู้ป่วยอยู่ด้วย เมื่อหมอบอกเสร็จแล้ว ผู้ป่วยจะไหว้ครูและบอกกล่าวตามคำหมอ ขอให้หาย และขออโหสิกรรมต่อเจ้ากรรมนายเวร เพื่อให้หมดเวรหมดกรรมซึ่งกันและกัน
เมื่อผู้ป่วยหายแล้ว ต้องไปทำบุญอุทิศส่วนกุศลให้บรมครู ปู่ชีวกโกมารภัจจ์ ครูผู้ถ่ายทอด ปู่ไกร และคุณแม่บรรจง โดยเงิน 39 บาทในขันครู หมอจะนำไปทำบุญอุทิศส่วนกุศลให้ท่านเหล่านั้น
หลังจากตรวจและวินิจฉัยอาการของผู้ป่วยทั้งจมูกและทวาร พบว่าเป็นโรค หมอจะอธิบายสาเหตุของโรคก่อนทำการรักษา โดยจะบันทึกประวัติผู้ป่วย (เวชระเบียน) รวมถึงอาการก่อนมาพบหมอ จากนั้นจะใช้ไม้พันสำลีฆ่าเชื้อ จุ่มยา 1–4 ไม้ ตามชนิดของโรค ทาบริเวณหัวและจุดที่ติดเชื้อทั้งจมูกและทวาร
ระหว่างการรักษา หมอจะบันทึกอาการ การใช้ยา และถ่ายรูป (โดยได้รับอนุญาตจากผู้ป่วย) ผู้ป่วยจะรู้สึกดีขึ้นเรื่อย ๆ จนกระทั่งหายเป็นปกติ
หมอจะซักประวัติ พูดคุย สอบถามอาการ สภาพแวดล้อม และพฤติกรรมการกินของผู้ป่วย เพื่อหาสาเหตุและแนะนำวิธีป้องกันไม่ให้กลับมาเป็นอีก “การป้องกันดีกว่าการรักษา”
